离婚时，夫妻共同经营的个体工商户分割方式有：一是由一方继续经营，获得经营权的一方对另一方进行经济补偿，补偿金额根据个体工商户的资产、收益、经营前景等因素确定；二是将个体工商户转让，分割转让所得款项；三是若双方都有经营能力且愿意，可协商分开经营，但需办理相关变更手续。分割时需对个体工商户的资产、负债等进行清算，明确双方的权利义务。
案例
陈先生和林女士共同经营一家小吃店（个体工商户），生意较好。离婚时，双方都想继续经营。法院经审理，综合考虑双方的经营能力、对店铺的贡献等因素，判决店铺由陈先生继续经营，陈先生向林女士支付店铺评估价值的 55% 作为补偿，同时承担店铺的相关负债。
法律分析
个体工商户的财产属于夫妻共同财产，其经营权也具有财产价值。根据《中华人民共和国民法典》和《个体工商户条例》相关规定，离婚时应合理分割个体工商户的财产和经营权。法院在处理时，会考虑保障个体工商户的持续经营，同时公平分配财产权益，兼顾双方的经营能力和意愿。
律师建议
夫妻共同经营个体工商户时，要规范财务记录，明确资产和负债情况。离婚时，先对个体工商户进行清算，评估其价值。协商分割时，充分考虑双方的实际情况，选择合适的分割方式。若协商不成，向法院提供经营记录、财务报表等证据，证明自己对店铺的贡献和经营能力，争取有利的判决结果。办理变更手续时，要遵守相关法律法规的规定。